Nakládání s odpady zahrnuje jejich třídění, skladování, evidenci a odvoz v souladu s legislativou. Týká se každého provozu a podléhá kontrolám.

Provozovatel musí zajistit oddělený sběr složek odpadu, vhodné shromažďovací prostředky, smlouvy s oprávněnými firmami a průběžnou evidenci. U nebezpečných odpadů platí přísnější režim skladování i dokladování.

Správné nakládání s odpady plní zákon, snižuje náklady a podporuje udržitelnost. Facility management ho zajišťuje jako standardní součást provozu objektu.